shRNA(short hairpin RNA)是一段具有緊密發卡環的RNA序列,包括兩個短的反向重復序列和連接兩個重復序列的Loop區,是一種將小干擾RNA(siRNA)輸送到活體中的形式。siRNA序列可以作為“短發夾”結構克隆進質粒載體中,質粒進入細胞后,該發夾序列表達出來形成雙鏈RNA(dsRNA),并進入RNA干擾(RNAi)通路,最終實現基因沉默的效果。

shRNA文庫應用方向

shRNA文庫應用非常廣泛,主要應用在基因功能研究和基因治療等方面:

  1. 基因功能研究:利用shRNA文庫進行高通量篩選,闡明信號轉導通路、發現新的藥物作用靶點[1-3];
  2. 基因治療:使用腫瘤特異性啟動子如hTERT啟動子、survivin啟動子或組織特異性啟動子如酪氨酸酶啟動子、骨鈣素啟動子引導針對某些癌基因或抗凋亡分子的siRNA或shRNA表達,從而達到特異性殺傷腫瘤細胞的目的[4];
  3. 治療病毒性疾?。?siRNA可以介導人類細胞的細胞間抗病毒免疫,病毒感染能被針對病毒基因和相關宿主基因的siRNA所阻斷[5]。

shRNA文庫服務優勢

  1. 可定制化對shRNA文庫載體進行改造,實現可誘導型shRNA文庫或帶有特殊篩選標記的shRNA文庫;
  2. shRNA文庫特性較穩定,不易降解;
  3. Syno? 3.0高通量合成shRNA文庫,可縮短合成周期,降低合成成本。

shRNA文庫泓迅案例
使用Syno? 3.0芯片合成的方法,可以高通量、低價格的合成shRNA序列,可定制化的構建shRNA文庫載體,并可進行慢病毒包裝服務。經過NGS驗證后,最終檢測shRNA文庫正確率在70%以上。
shRNA library

shRNA文庫構建流程圖

服務詳情

服務名稱 產品/服務內容 交付周期 交付項目 價格
shRNA文庫構建 合成shRNA芯片并構建文庫 40-50個工作日 液態庫質粒50-200ug,甘油菌一管 咨詢

參考文獻

[1] A comparison of multiple shRNA expression methods for combinatorial RNAi. Genet Vaccines Ther. 2011 Apr 17

[2] shRNA library screening identifies nucleocytoplasmic transport as a mediator of BCR-ABL1 kinase-independent resistance. Blood. 2015 Mar 12

[3] shRNA screening identifies JMJD1C as being required for leukemia maintenance. Blood. 2014 Mar 20

[4] Construction of a novel vector expressing the fusion suicide gene yCDglyTK and hTERT-shRNA and its antitumor effects. Exp Ther Med. 2012 Sep;4(3):442-448

[5]Qiu Y, Xu Y, Zhou X.Human virus-derived small RNAs can confer antiviral immunity in mammals. Immunity. 2017 Jun 20;46(6):992-1004

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