現代新藥研發的首要任務是篩選、確定和制備有效的藥物靶點。CRISPR-Cas9在多種類型的細胞和組織中都具有高效精確的基因編輯能力,據近期文獻[1-3]報道,以CRISPR-Cas9為基礎的基因編輯技術在一系列藥物靶點篩選中展現出了極大的應用前景。

通過構建sgRNA文庫,利用慢病毒轉染細胞,對疾病發生、維持癌細胞生長、存活及發展等過程具有重要作用的蛋白及其結構域的大規模篩選,結合NGS及數據分析,對尋找合適的藥物作用靶點,研發新藥尤其是癌癥治療藥物具有重要意義。

研究思路

新藥研發靶點篩選研究思路
  1. 基因組或者Panel
    范圍內的基因調取與
    sgRNA設計
  1. Syno?2.0基因
    合成
    載體構建
  2. sgRNA文庫構建
  3. 慢病毒文庫制備
  1. 細胞活力、增殖、凋
    亡等表型檢測
  2. 結合免疫染色、流式
    細胞術等方式得到篩
    選后的細胞
  1. 利用NGS及生物信息分析
    獲取篩選前后的基因組信息
  2. 獲得富集sgRNA所對應的
    候選基因
  3. 后續細胞株構建或動物模
    型建立

新藥研發靶點篩選服務優勢

right一站式服務
泓迅科技提供從sgRNA設計、sgRNA文庫構建、慢病毒包裝,到靶點篩選及后續驗證工作的整體解決方案

right專利Syno? 3.0芯片合成平臺
高通量、低成本合成sgRNA文庫,文庫構建覆蓋率95%以上

right高通量功能篩選平臺
提供全基因組文庫篩選,平行分析大量細胞的基因功能,包括細胞活力、增殖、凋亡等表型檢測,鑒定相關候選基因

right生物信息分析
經驗豐富的生物信息分析團隊,可通過分析NGS數據,篩選出靶點候選基因

新藥研發的靶點篩選應用案例

【應用案例1】 基因敲除方法篩選與人類腫瘤生長和抗藥性相關的基因

【應用案例2】基因組篩選方法檢測小鼠體內腫瘤細胞的生長和轉移情況

【應用案例3】 lentiCRISPR系統載體改良及GeCKO文庫用于功能基因組文庫篩選

參考文獻
[1].Parnas, O., et al., A Genome-wide CRISPR Screen in Primary Immune Cells to Dissect Regulatory Networks. Cell, 2015. 162(3): p. 675-86.
[2].Sanjana, N.E., Genome-scale CRISPR pooled screens. Anal Biochem, 2016.
[3].Varshney, G.K., et al., A high-throughput functional genomics workflow based on CRISPR/Cas9-mediated targeted mutagenesis in zebrafish. Nat Protoc,2016. 11(12): p. 2357-2375.